В Счетной палате также отметили, что федеральный проект по оздоровлению Волги имеет сложную структуру управления.
В Минприроды и Минстрое были созданы два проектных офиса, но представленные в электронных системах данные об исполнении проекта не соответствуют друг другу.
При этом технические нарушения допустили не только проектные офисы, но и непосредственные исполнители, например, комитет ЖКХ Волгоградской области не разместил на официальном сайте отдельные документы о деятельности муниципальных учреждений.